来自半人马座比邻星的外星人哈哈，与数十亿年前比邻星人从地球带走的恐龙蛋中孵化出的，全宇宙最后一只恐龙哈小龙，来到地球，与以爱科学的小学“女汉子”公孙兰，以及她的爸爸妈妈、少科站的伙伴诸葛聪明、杨燕，竞争对手司马晴空及其跟班夏冬等，在少科站、家中和街心花园等地发生种种生活趣

故事承接第一季的剧情，哈哈和哈小龙再次留在了地球上，帮助兰兰完成上一季的宇宙探索梦想。同时，比邻星遭遇新的危机，人工智能系统因为太阳分子风暴的影响而毁坏，比邻星β陷 入一片瘫痪。哈哈继承到了“复制幻影"的能力，可以吸收地球上各种各样的职业，同时学习到职业所需的能力，收集能力宝石后帮助比邻星重建。

外星人哈哈与全宇宙最后一只恐龙哈小龙来到地球，为了重返比邻星β，哈小龙为了复辟恐龙帝国，与公孙兰等一起穿梭时空隧道，探索宇宙奥秘，遭遇了无数冒险奇遇……

外星人哈哈与全宇宙最后一只恐龙哈小龙来到地球，为了重返比邻星β，哈小龙为了复辟恐龙帝国，与公孙兰等一起穿梭时空隧道，探索宇宙奥秘，遭遇了无数冒险奇遇……

宇宙中，来自半人马座比邻星β的哈哈正在追捕危险宇宙的逃犯哈小龙，并经过地球。而同时，公孙兰、杨燕和诸葛聪明正在空旷地带做他们的“外星人交流”试验，不慎实验失败，一道闪电划破长空，击中哈哈和哈小龙的飞船，哈哈的整个飞船掉下来，砸在公孙兰的头上，产生了一系列的反应。而哈哈也拥有了“移情换形”的能力——只要周围的人拥有强烈的情绪反应，开心、愤怒、悲痛等，哈哈就能够将这些反应以巨大化、着火、闪电、液化等形式外化出来，只有将这些情绪平复，才能复原，并因此不断发生各种尴尬、疯狂、而奇妙的故事。